在EVA新剧场版最终章《EVA:终》的结局中，各个角色都走出了他们自己的心理阴影，实现了自我成长。真嗣保护了他想要保护的人，明日香除了得到了真嗣的回应与感谢之外，也终于有了能摸摸她的头的人，碇司令也在最终的决战中，和唯有了怀紧贴背的拥抱。此外，所有人类也终于从EVA和NERV的战斗中解脱出来。真希波带着真嗣来到了一个全新的世界，电影以他们的离开作为结尾。这个结局为这部经典动画画上了一个圆满的句号，给予了观众希望与勇气，让人迈向属于自己的新世纪。

结局是真嗣在负世界和他的父亲和解，然后拯救了明日香、熏和白丽，最后在他准备牺牲自己的时候，碇唯和碇源堂推开了他，真希波出现把他带向了新世界，剧终。