《东邪西毒：终极版》与早期版本的区别在于这部影片是后来重新修复过的，时间为93分钟。

一、删减镜头

1、与《东邪西毒》相比，《东邪西毒：终极版》一开始的图像略微有些不同，王家卫在一场风暴中加入了一个巨大的黄色月亮。此外虚弱的洪七受他妻子照顾的场景有两个，王家卫删掉了一个。

2、武打部分做了删剪，比如梁朝伟杀马贼的那场戏就剪短了，全片比《东邪西毒》少了7分钟。

3、取消了旁白，由倒序改为正序。此外影片颜色由冷到暖，修改为油画感觉。

4、《东邪西毒》光是拍一个主要给发行商看的场面就花掉了150万港币，但这一段在《东邪西毒：终极版》中被剪掉，因为跟剧情没多大关系。

区别在于终极版中加入了一些被删除的片段，包括了一些角色的扮演者，还对其中一些具体的场景进行了修改。
1,东邪西毒94版和终极版的区别在于终极版中加入了一些被删除的片段。
2,东邪西毒94版和终极版这两个版本在剪辑、配乐和画面处理方面存在一些不同，终极版相较于94版多了一些被删除的部分，这些被删除的部分让观众能够更好地理解电影的主题和角色之间的关系。
3,享有盛名的电影导演王家卫将香港武侠小说《神雕侠侣》中的主要角色搬上银幕，创造了影史上独特的美学体系，东邪西毒94版和终极版 都是王家卫的代表作之一，从电影制作和艺术表现角度来看，这两部电影的确存在着一些差异。

区别在于终极版是对94版进行修复的。包括删减镜头和增加镜头。删减了武打部分7分钟和部分吻戏，增加了一个巨大的黄色月亮，还是颜色由冷变暖等。

区别在于王家卫把一些地方重新调整了次序，如回忆里的张曼玉、刘嘉玲、林青霞几个女人出场的次序有些变动，使得终极版比94版本更容易让人看明白。